北京大学南宁附属实验学校作为广西壮族自治区和南宁市两级政府重点引进的教育项目，于2001年开始筹办， 2002 年 9 月经北京大学、南宁市教育局批准成立，并正式开学。学校由北京北大教育投资有限公司和广西荣和企业有限责任公司共同投资创办，是一所集学前班、小学、初中、高中为一体的一贯制寄宿学校。